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余年寄山水
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2021年02月09日 11:19
最佳经验
本文由作者推荐

孙中山故居-

2021年2月9日发(作者:马克吐温的四大名著)


核磁共振法测量中间产物证明结核分枝杆菌


aurum MO1


的细


胞色素


P450


氧 化硫代吗啉和吗啉




Bruno


Combourieu


,


Pascal


Poupin


,


Pascale


Besse


,


Martine


Sancelme


,


Henri


Veschambre


1


, Nicole Truffaut2 & Anne-Marie Delort1,*



1


Laboratoire


de


Synth`ese,


Electrosynth`ese


et


Etude


de


Syst`emes


`aInt´


erê


t


Biologique, UMR 6504 CNRS, Universit´


e Blaise Pascal, 63177 Aubi`ere Cedex, France;


2Laboratoire de G´


en´


etique Microbienne, Universit´


e Technologique de Compi`egne, B.P


.


649,




60206


Compi`egne,


France


(*author


for


correspondence,


e-mail:


amdelort@)



1


2


1


1


【关键词】


:细胞色素


P450


、核磁共振、结核分枝 杆菌、吗啉、硫代吗啉





【摘要】




通过分光光度法检测结核分歧杆菌


aurum MO1


在参与化工废物吗啉的降解过程中,



取了一种 可溶性的细胞色素


P450


。为了进一步了解它的信息,利用核 磁共振


(NMR)


来检测


硫代吗啉生物 降解动力学过程。


这项技术可以鉴定两种中间产物:


硫代吗啉产 生亚砜是由于


S-


氧化以及环裂解生成亚硫基二乙酸。


S-


氧化(


S



SO


)表示细胞色素


P450


的催化作用产


生一种反应。甲吡酮是细胞色素


P450


的抑制剂,它在硫代吗啉和吗啉的降解过程中对


M.


aurum MO1


菌的抑制作用证明含有细胞色素

< p>
P450


。上述研究结果以及吗啉降解初级代谢产



2


-



2-


氨基乙氧基)乙酸和乙醇酸形成速率的下降,证明了细胞色素


P450


在生物降解


过程中对


C-N


键断裂起关键作用。





【简介】




吗啉为氮杂环化合物,


含有仲胺基团,


主要用于橡胶助剂生产与应用(催化剂,


溶剂,


抗氧化剂等)< /p>



Mjos1978


< br>;


Anon1989


年)


,它 的应用范围不断扩大,通过工业废水,进入


环境。根据报道,由于其对亚硝化作用产生有 力的诱变并产生致癌物质


N-


亚硝基吗啉(匿

< br>名


1989



; Enzman n



1995


年)


所以它在废水甚至食品中的存在引起人们格外关注



Singer



Lijinski1976


年)




在文 献中,许多研究工作已报道吗啉的生物降解属于结核分枝杆菌株(


Cech



1988



1988



Dmitrenko


< br>Gvozdyak



Knapp



1982


年;


Knapp

< p>


Brown 1988





Mazure



Truffaut 1994



; Poupin


等,


1998


年)


,节杆菌(

< br>Dmitrenko


等人,


1987

年)或革兰氏阴性菌



Knapp 1996


年)等。生物降解途径没有确定,因为没有直接检测中间产物的方法。然而,


在最近的研究中(


Combourieu


等,

< br>1998



,通过使用原位核磁共振光谱测定结核分枝杆 菌


aurum MO1


降解过程的两种代谢产物,使中间产物可 以被定性和定量。降解过程的中间产


物为


2 -



2 -


氨基乙氧基)乙酸和乙醇酸 ,这与


Swain


所鉴定的分歧杆菌降解过程的中间

< p>
产物一致


(Swain



. 1991)




为了了解结核分歧杆菌


aurum MO1

生物降解途径的机理,


我们将进一步研究酶参与的


类型。< /p>



Knapp



Knapp


等人,


1982


年)和


Mazure



Mazure



Truffaut 1994


年)表明,吗啉降< /p>


解与耗氧量有关,


说明可能有单氧酶参与。


单氧酶是广泛分布的酶,


它使氧分子活化,


一个


氧原子进入底物,另外一个被还原成水。大量的单氧酶含有一种血红蛋白称为细胞色素


P450



这些细胞色素


P4 50


参与各种阶段的内源性化合物的合成


(类固醇,

< p>
脂肪酸)



Waterman

等,


1986; Jefcoate1986


年)


,氧化解毒和消除许多疏水性外来物质(污染物,药品,农药


...




Wislocki

等人,


1980


年,


Guenge rich1990



a



。因为它们广泛分布在生物体中,且在生


物化学,


药 理学和毒理学有重要的作用,


所以现在细胞色素


P450


已被广泛研究



Guengerich


1990



b; Ortiz de Montellano 1986


年;


Ruckpaul & Rein 1984



, 1990


年 )



几种细菌


(从链

< br>霉菌,假单胞菌,巨大芽孢杆菌)的细胞色素


P450


的 晶质结构被人们熟知,它们用来作为


人类细胞色素


P450


的模型(


Fulco1991


年,


1991



Asperger & Klebe r



。其他几个菌属也含


有细胞色素< /p>


P450



例如红球菌属,


它非常接近结核分枝杆菌



Asperger


等人,


1990


年;


Karlson



1993


年;


Nagy



1995


年)



最近,


我们由一株结核分枝杆菌


strain


菌株证明细胞色素


P45 0


参与吗啉降解的过程(


Poupin



Truffaut



1996


年;


Poupin



1998



。这促使我们进一步研


究结 核分枝杆菌


aurum


MO1


的细胞 色素


P450


在外源性物质生物降解过程中可能发挥的作


用。



在这项研究中,


我们通过传统光谱光度检测法证明,


分歧杆菌


aurum M O1


中的可溶性


细胞色素


P450


存在于吗啉和硫代吗啉中。为了证明这种细菌在外源性物质降解途径中起的

< br>关键作用,我们通过核磁共振检测硫代吗啉的生物降解过程。结核分歧杆菌


aur um


MO1



硫代吗啉上不生长(< /p>


Mazure



Truffaut



1994



,但能 够使其降解。因此,预计代谢产物积


累的时间,


可以让我们更好 地了解杂环物质生物降解途径。


此外,


硫代吗啉的硫原子可以很


容易地氧化。


直接在水溶液中使用核磁共振技术,


可以对中间产物进行定性和定量分析,



明其可能参 与硫代吗啉的降解过程。加入细胞色素


P450


酶抑制剂(即甲 吡酮)到含有硫代


吗啉或吗啉的培养基中,发现它对结核分歧杆菌


aurum


MO1


的降解性能有抑制作用,从而

< p>
证明这种酶在两种化合物的生物转化中发挥的另一种关键作用。





【材料和方法】



< br>化学品:


硫代吗啉,


吗啉,


甲吡 酮,


间氯过氧苯甲酸


(购于


Sigma Aldrich


公司,


St. Quentin


Fallavier,


法国)


TSPd4


(购于


EurisoTop


St. Aubin


,法国)




生长条件:


结核分歧杆菌


aurum MO1



500


毫升锥形瓶

< p>
(加入


100


毫升的大豆胰酶肉

< br>汤)



30


< br>,


200 rpm


转速下培养


4 8


小时(


l'Etoile


,法国生物 梅里埃,马西)


。结核分歧杆菌


aurum MO1

< p>
培养在无机盐中(


Knapp


缓冲液:

< p>
1L


去离子水


,KH2PO4 1 g, K2HPO4 1 g,


FeCl3.6H2O 4 mg



MgSO4.7H2O 40 mg, pH 6.6



,


滴加


10mM< /p>


吗啉或


20 mM


醋酸,


进行分


光光度测量。进行硫代吗啉实验时,细胞生长在富集培养基中,离心收集 (


8000rpm



10



钟)


,用无机盐介质洗一次。然后在含有


5 mM


的硫代吗啉介质的液体培养基中摇床振荡培


6


小时(


30

< br>℃,


200 rpm





外源性物质培养:


收集细胞,在


5


℃,


9000rpm


下离心


15

< p>
分钟。去除上清液,用纳普


缓冲液洗两次沉淀物,最后细胞悬浮在这个缓冲 液中(


5


克湿细胞


50


毫升缓冲液)


。将细胞


培养在


500


毫升锥形瓶中,在


30


℃下,搅 拌(


200rpm




10mM


硫代吗啉或吗啉作为唯一能


源。加入抑制剂甲 吡酮(


5



10mM

< br>)进行试验。在相同条件下,在细胞培养中不加入抑制


剂作为对照,同样不加入细 胞做相同培养作为对照。样本(


1


毫升)每隔

< br>12


小时取一次样,


共测到


72


小时。在


12000



/


分钟条件下,离心


5


分钟, 取上清液,并立即冷藏,直到核磁


共振分析。



细胞色素


P450


的分光光度分析:

< br>在


4


℃下离心(


8000rpm



10


分钟)


,洗涤,分枝杆


菌细胞悬浮在含有


0.3mM

< br>苯甲基磺酰氟的磷酸盐缓冲液(


50 mM


)中(


pH



7.4



。通过细


胞破碎仪(


SLM- Aminco



,在


18,000 p si


下对细胞加压,并在


30000



/


分钟(


4


℃ )下离心


30


分钟,细菌的细胞壁被打破。在获得的上清液加入 亚硫酸氢钠,将上清液均匀的分到两


个比色皿中,在


CO


存在时,得出不同的吸光度



(Peterson




Lu 1991



).



91mM


.cm



消光系数是用来确定(大村和佐藤,


1964


年 )粗提取物中细胞色素


P450


的含量。所有的光


度分析测定用岛津


UV160A


分光光度计,用


Bradford


法测定蛋白浓度(


Bra dford 1976


年)




核磁共振光谱:


制备核磁共振样本:上清液(


540μL


)在


D


2

< br>O


溶液


60μL


中添加


8mM



TSPd4


, 用


4N



NaOH

溶液调


pH



10


。调整


pH


值时应避免化学位移的变化。重水作


为锁场和匀场。


TSPd4


做化学位移(


0ppm


)和定量的参比。



1H NMR



:




21


℃下,



A


V


ANCE300 DSX


光谱仪 ,在


300.13


兆赫下进行核磁共振


光谱或在


400.13


兆赫下用


400 AC


布鲁克的光谱仪,


用含


500μL


样品的直径为


5


毫米的管子;


通过传统


NOE


核磁共振仪程序水被饱和度所抑 制。


64


扫描收集。


采用傅里叶变换之 前没有


使用过滤器,在光谱实验基线校正前先进行布鲁克软件集成。在这些条件下,检出 限为


0.05mM




代谢产物的定量:



代谢产物的浓度,计算公式如下:



[M] =



9 Ao×


[TSPd4]



/




Aref





[M]


是的代谢物的浓度;


Ao


是代谢产物;


M


核 磁共振谱共振区范围;



[TSPd4]


是浓度的参考;



Aref


是参考在


1H NMR


谱的共振区;



B


是代谢产物


M


在信号集


成的 质子数;



9


是在


0 ppm


的共振质子数。



-1


-1




1



不同细胞提取物的


CO


光谱。结核分歧杆菌


aurum MO1


在吗啉中培养(谱


A




在醋酸中培养(谱


B



,以及在硫代吗啉中培养(谱


C


< br>,蛋白质含量分别为


10



10



11.5


毫克


/


毫升。



合成亚砜的硫代吗啉(< /p>


Madesclaire1986


年)


: 二氯甲烷溶液(


50


毫升)中含有硫代吗


啉(


500


毫克,


4.85


毫摩尔)


,在


-15


℃ 冷却,搅拌后,在二氯甲烷溶液中(


25


毫升)逐滴滴


加间氯过氧苯甲酸(


1.05 eq., 1 g



。另外搅拌溶液


3


小时,直到溶剂 被分离,通过闪光柱层


析法原油残渣被纯化(洗脱液:甲醇


/< /p>


乙酸乙酯


93/7


,获得


70


%的亚砜。红外:宽带


1070-1130cm


-1



MS< /p>



EI




119



M+


)< /p>



102



71



56


。核磁共振光谱:分配不同的信 号是用


一维和二维



COSY



1H-1H



1H- 13C



的实验。


根据加列戈等人给予 的


13C


化学位移


< br>1993


年)一个相关的杂环


1H-13C


分配质子(


HC- HD


)和(


HA-HB


)分别连接到< /p>


C-2



C-3




核磁共振


(400.13 MHz; CD3OD) 8:



2.69 ppm (ddd, 2H, HB or HA);



2.87 ppm (ddd, 2H, HC or HD );



2.96 ppm (ddd, 2H, HA


or HB );



3.39 ppm (ddd, 2H, HD




HC).


耦合常数


: JAC = 13.9 Hz, JAD =2.4 Hz, JBC =3.1 Hz; JBD = 2.9 Hz.



13C


核磁共振



(100.61 MHz; CD3OD): 39.2 ppm (C-2); 47.8 ppm (C-3).


鉴定的代谢产物


X



与硫代吗啉培养


24


小时后,


上清液只包含代谢产物的


X



经过冷


冻干燥可以进行质谱分析(电子冲击)

< br>。质谱(


EI




150



M +




132



104



77



60






【结果】




【光谱光度法测量诱导细胞色素


P450




在以前的研究中(


1996< /p>



Poupin



Truffaut Poupin



1998

< p>
年)


,我们证明了吗啉,


特别是

< br>strain


RP1


菌在降解分枝杆菌时有一种可溶性 的细胞色素


P450


参与。为了证实结核


分歧杆菌


aurum


MO1


中存在 单氧酶,我们测得的一氧化碳光谱差,表明亚硫酸氢钠降低吗


啉诱导细胞和非诱导细胞的 可溶性部分。




(图


1



:当结核分歧杆菌


aur um


MO


在吗啉中培养时,吗啉作为唯一的碳源、氮源和


能量,其峰值在频谱(图


1


,谱

< p>
A


)上


449 nm


处, 表明存在一种可溶性的细胞色素


P450


由于细胞在醋酸下生长,没有观察到此峰(图


1


,谱


B



,则表明吗啉诱导合成这种酶。使


用硫代吗啉作为底物时(图


1


,频谱


C



,获得了类似的结果。细胞色素

< p>
P450


每毫克吗啉细


胞提取物含蛋白质约


70


pmol


,每毫克硫代吗啉细胞提取物 蛋白质约


60


pmol


。其他像吡咯


烷和哌啶胺结构相关的物质,也可诱导合成可溶性的细胞色素


P 450


(数据未显示)


。我们可


以合理 地得出结论,这些环胺可以诱导血红素单氧酶的合成。






【结核分歧杆菌


aurum MO1


降解硫代吗啉】




通过核磁共振频谱研究分析了结核分歧杆菌


aurum


MO1


的上清液的休眠细胞(


5


克湿


细胞,纳普缓冲液


50


毫升)


(详细见上文的材料和方法部分)


,将其核磁共振光谱与 对照频


谱进行了比较。图


2


光谱收集是


0



8



12



22.5 H





在频谱的零时间,可看见三个主要的信号:在


0 ppm


的单峰属于


TSPd4


的甲基基团,


另外两个峰为


2.66



3.08


ppm


分别对应


CH2< /p>



A


)和


CH2



B


)的硫代吗啉(图


8



。在


8

< br>小时时,硫代吗啉完全被耗尽,然后发现新的信号,特别是


2.86



2.99



3.10



3.39


PPM


这组四个信号共鸣,这似乎属于同一分子


(S)


,对新


(S)


信号进行检测表明它们先增加,然后


减 少。在


22H30


,中间产物(


S


)已经消失了。在


8


小时时,一个新的信号 (


X




3. 25 ppm


处单共振,其浓度随时间增加。



光谱光度实验先前已证实存在一种可溶性的细胞色素


P450

< br>,


然后做氧化硫代吗啉的硫


原子的实验(


Oldham


1989


年)




S


)的四个信号的表明它们耦合。 此外,它们的对称性表


明相应质子属于一环。因此,中间化合物(


S


)可能是亚砜。为了证实这一假说,进行式


1

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